Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms