Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PKHD1P08F94 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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