Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTA1P02549 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms