Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KDM4BO94953 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms