Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms