Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTNSO60931 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTNSO60931 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms