Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SCO2O43819 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms