Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXA3O43365 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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