Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SGSM2O43147 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms