Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CLOCKO15516 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms