Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CASKO14936 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CASKO14936 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASKO14936 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASKO14936 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms