Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POLR3AO14802 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POLR3AO14802 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms