Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E9PBE3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E9PBE3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E9PBE3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E9PBE3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E9PBE3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E9PBE3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E9PBE3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms