Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC169A6NNP5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms