Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIPT2A6NK58 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms