Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms