Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CAB39Q9Y376 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CAB39Q9Y376 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms