Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms