Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC4Q9Y296 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms