Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZRN3Q9UPQ7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms