Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TPCN1Q9ULQ1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms