Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNMA8BQ9ULN7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNMA8BQ9ULN7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms