Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NRXN1Q9ULB1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms