Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FBXL4Q9UKA2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms