Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNL1Q9UK58 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNL1Q9UK58 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms