Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MLH3Q9UHC1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms