Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ABCF2Q9UG63 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ABCF2Q9UG63 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms