Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFDP1Q9UEE9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms