Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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