Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL13Q9P2N7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms