Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC180Q9P1Z9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms