Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCHIP1Q9P0W5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms