Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM53CQ9NYF3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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FAM53CQ9NYF3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM53CQ9NYF3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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