Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEPEQ9NQ76 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms