Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KIAA1549Q9HCM3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms