Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NRDE2Q9H7Z3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NRDE2Q9H7Z3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms