Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms