Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM54Q9BYV2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms