Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABARAPL3Q9BY60 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABARAPL3Q9BY60 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms