Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RSPO3Q9BXY4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms