Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms