Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
REPIN1Q9BWE0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
REPIN1Q9BWE0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms