Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RIOK2Q9BVS4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RIOK2Q9BVS4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms