Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms