Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MCMBPQ9BTE3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms