Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYT17Q9BSW7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYT17Q9BSW7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms