Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RTKNQ9BST9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RTKNQ9BST9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms