Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM79Q9BSE2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMEM79Q9BSE2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM79Q9BSE2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMEM79Q9BSE2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM79Q9BSE2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms