Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCNS3Q9BQ31 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms