Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RETNLBQ9BQ08 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms